162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3701 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  80.7 
 
 		 402 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  80.7 
 
 		 402 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  80.12 
 
 		 402 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  83.03 
 
 		 402 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  66.48 
 
 		 403 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.84 
 
 		 404 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  65.91 
 
 		 403 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  67.25 
 
 		 398 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  67.05 
 
 		 400 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  70 
 
 		 406 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  64.07 
 
 		 392 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  70.59 
 
 		 394 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  66.08 
 
 		 402 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  57.53 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  67.28 
 
 		 393 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  63.74 
 
 		 404 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  67.5 
 
 		 397 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  63.74 
 
 		 405 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  64.2 
 
 		 401 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 400 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  70 
 
 		 400 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  64.15 
 
 		 407 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  66.25 
 
 		 404 aa  207  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 414 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  61.25 
 
 		 399 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  58.58 
 
 		 418 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  59.01 
 
 		 409 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  63.69 
 
 		 403 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  61.25 
 
 		 401 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 389 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  55.97 
 
 		 387 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  55.97 
 
 		 387 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  60.84 
 
 		 401 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  60.84 
 
 		 401 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  56.79 
 
 		 404 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  60 
 
 		 402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  60.12 
 
 		 446 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  60.12 
 
 		 446 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  60.12 
 
 		 402 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  60.12 
 
 		 402 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  60.12 
 
 		 402 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  60.12 
 
 		 402 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  59.2 
 
 		 403 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 453 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 404 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 386 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  48.95 
 
 		 386 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  44.05 
 
 		 386 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 376 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  40.59 
 
 		 417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  47.18 
 
 		 388 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  44.68 
 
 		 420 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 411 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 388 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 422 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 		 385 aa  118  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 420 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 406 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 393 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 402 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  42.25 
 
 		 394 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 394 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  40.24 
 
 		 406 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  37.71 
 
 		 426 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 396 aa  99  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 429 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 420 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 455 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 434 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 412 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 404 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 395 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  42 
 
 		 391 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  42 
 
 		 391 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 388 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  42 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 419 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  36.3 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 382 aa  68.6  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>