132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2894 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  100 
 
 		 406 aa  772    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  56.28 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 		 412 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  38.06 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  34.51 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 392 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  32.37 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.66 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  35.62 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  32.37 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  32.43 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  33.16 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  34.5 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  31.69 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  32.89 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  32.89 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  32.89 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  32.38 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  32.89 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  40.24 
 
 		 222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.75 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 395 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>