More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0601 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  801    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  51.24 
 
 
417 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  50 
 
 
420 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  49.62 
 
 
420 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  45.89 
 
 
404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
388 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  39.69 
 
 
376 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  47.09 
 
 
393 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  46.81 
 
 
386 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 
393 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  37.63 
 
 
386 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
385 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
386 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  36.96 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  37.96 
 
 
399 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
394 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  35.49 
 
 
394 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  36.18 
 
 
399 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  37.95 
 
 
418 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  35.44 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
403 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.66 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
409 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  37.66 
 
 
396 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  37.06 
 
 
389 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  36.52 
 
 
406 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
392 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  35.66 
 
 
406 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
404 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  35.81 
 
 
402 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  35.81 
 
 
402 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
403 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
405 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  35.81 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  37.3 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  37.99 
 
 
398 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  33.08 
 
 
388 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  38.32 
 
 
403 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  35.49 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  35.75 
 
 
397 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 
400 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  35.37 
 
 
403 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
400 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  36.54 
 
 
414 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  36.59 
 
 
387 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  35.79 
 
 
402 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  36.34 
 
 
387 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  33.25 
 
 
401 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  35.34 
 
 
401 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.64 
 
 
404 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  35.08 
 
 
401 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  34.49 
 
 
407 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  33.52 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  35.47 
 
 
393 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  34.04 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 
394 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  34.82 
 
 
404 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
404 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  37.06 
 
 
402 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  36.03 
 
 
403 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  33.85 
 
 
391 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  33.85 
 
 
391 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  35.34 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  33.7 
 
 
388 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.01 
 
 
426 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  29.1 
 
 
453 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
455 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  44.32 
 
 
222 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  30.97 
 
 
406 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
420 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  28.14 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  29.95 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
420 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  28.25 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  29.44 
 
 
382 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  29.21 
 
 
429 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  27.47 
 
 
384 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  27.47 
 
 
384 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
370 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  25.91 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
399 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
434 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
395 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  28.16 
 
 
393 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
389 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  26.7 
 
 
394 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  29.41 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.7 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  24.31 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>