More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2241 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  100 
 
 		 418 aa  816    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  87.22 
 
 		 401 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  96.49 
 
 		 399 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  64.75 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  59.28 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  56.64 
 
 		 404 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  56.39 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  57.71 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  57.07 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  57.33 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  57.33 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  57.56 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  55.87 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  55.85 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  57.33 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  58.67 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  52.76 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  56.6 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  53.99 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  55.59 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  53 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  55.87 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  53.02 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  57.1 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  51.3 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  52.48 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  52.48 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  56.95 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  57.22 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  54.2 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  56.8 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  57.41 
 
 		 446 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  57.41 
 
 		 446 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  57.41 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  57.41 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  57.41 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  57.41 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 420 aa  246  8e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  38.08 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  40.51 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  38.56 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 386 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  58.58 
 
 		 222 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  37 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  38.12 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  35.65 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.66 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>