100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0131 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0131  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
370 aa  697    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00122667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  28.65 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
406 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  25.07 
 
 
389 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  24.48 
 
 
401 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
417 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.62 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  22.67 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  27 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  23.66 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  23.66 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
403 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  25.62 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  24.52 
 
 
407 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  26.26 
 
 
396 aa  89.4  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  22.04 
 
 
414 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
409 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  23.91 
 
 
401 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  23.44 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  23.88 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  25.34 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  24.25 
 
 
402 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  22.14 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  23.2 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  25.83 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  22.96 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  22.91 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  23.16 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  22.55 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  21.56 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  22.92 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  21.63 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  23.04 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  20.85 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  23.66 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  22.28 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  23.64 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  21.85 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  22.79 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  24.69 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  23.08 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  22.28 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  22.81 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  27 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  23.04 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  22.61 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  22.49 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  22.37 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  25.17 
 
 
222 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  22.11 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  21.54 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  21.35 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  24.2 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  24.53 
 
 
422 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  23.42 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  23.42 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  23.18 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  24.92 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  24 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
455 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  21.09 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  21.36 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  22.51 
 
 
394 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  23.76 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  23.25 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
420 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  21.14 
 
 
402 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
446 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  23.18 
 
 
446 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  23.18 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  23.18 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  31.03 
 
 
573 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  20.62 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  23.78 
 
 
414 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  20.5 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  23.36 
 
 
526 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  22.85 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  26.05 
 
 
397 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
458 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  22.98 
 
 
425 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>