75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2167 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  70.03 
 
 		 401 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  72.14 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  71.61 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  68.5 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  62.04 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  69.81 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  63.52 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  58.09 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  24.51 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.69 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  24.44 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.9 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.5 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.58 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.9 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.9 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.58 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  27.74 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  27.74 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.58 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.58 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  24.05 
 
 		 366 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3402  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.762536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.04 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.5 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  21.72 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>