73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1515 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  100 
 
 		 401 aa  750    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  58.36 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  56.89 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  56.12 
 
 		 414 aa  352  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  57.34 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 450 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 381 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  26.98 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  27.07 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.46 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  27.98 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  33.13 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.46 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 488 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  33.16 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  26.3 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.65 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.46 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3963  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5568  major facilitator transporter  28 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.89 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  27.5 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.89 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  25.16 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.89 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  20.71 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2287  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  25.31 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>