More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1897 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  817    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  74.12 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  31.61 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  26.93 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.21 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.36 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.07 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  30.41 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.41 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.48 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.48 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.93 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  24.19 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.93 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.94 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  26.15 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  25.07 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.16 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.56 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25.74 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  30.71 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  25.96 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  19.88 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.53 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.9 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  18.18 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  26.64 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.89 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  27.86 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>