208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0947 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4671  major facilitator superfamily MFS_1  89.8 
 
 		 398 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  28.93 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.53 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  30.49 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.8 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.2 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  28.53 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  28.53 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  25.6 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  25 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  25.6 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  30.66 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  24.53 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  27.68 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  25.2 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  27.31 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  23.85 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  24.12 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  24.94 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  23.85 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  21.58 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  25.31 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  22.98 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  22.22 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  26.95 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  22.45 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  22.45 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.35 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.35 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  26.06 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  24.13 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  24.13 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  25.61 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>