217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3941 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
383 aa  733    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  77.36 
 
 
392 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 
388 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  40.16 
 
 
386 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  38 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  37.43 
 
 
386 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  36.96 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  37.43 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  37.43 
 
 
386 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  37.43 
 
 
386 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  37.43 
 
 
386 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  36.69 
 
 
404 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  37.11 
 
 
386 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  37.54 
 
 
387 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  38.44 
 
 
385 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  39.48 
 
 
385 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  37.24 
 
 
387 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  40.22 
 
 
385 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  36.55 
 
 
382 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  37.22 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  36.19 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  36.15 
 
 
381 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  37.13 
 
 
377 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  34.94 
 
 
379 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  34.94 
 
 
379 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  34.81 
 
 
379 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  34.94 
 
 
379 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  36.75 
 
 
382 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  36.57 
 
 
382 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  40 
 
 
311 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
389 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
402 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  31.53 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  28.61 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.42 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  30.08 
 
 
394 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  29.02 
 
 
380 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  28.98 
 
 
380 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  30 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  29.02 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  30.16 
 
 
394 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  27.22 
 
 
407 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
430 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  30.41 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
394 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  27.62 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  29.01 
 
 
393 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  24.78 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  27.91 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  25.98 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  26.8 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  24.87 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  31.69 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  28.88 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  28.07 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28.41 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  29.29 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  24.87 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  24.91 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.19 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.92 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.3 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  25.9 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.74 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  25.9 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.9 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  29.43 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.94 
 
 
416 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  25.84 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.02 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.51 
 
 
412 aa  62.8  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.66 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.21 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.66 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  24.28 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4671  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  26.5 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  25.29 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.55 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  25.34 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
444 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  24.83 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>