207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3211 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  99.68 
 
 		 389 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  100 
 
 		 311 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  99.36 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  99.36 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  99.36 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  99.36 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  99.36 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  93.89 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  81.79 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  81.79 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  81.79 
 
 		 386 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  80.79 
 
 		 386 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  81.13 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  81.13 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  82.19 
 
 		 386 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  74.59 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  72.33 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 388 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 388 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  35.07 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.72 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  35.88 
 
 		 382 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  39 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 392 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.57 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 379 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  32.13 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  38 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  29.18 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 376 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 388 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 397 aa  96.3  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 388 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 380 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 394 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 402 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.42 
 
 		 410 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  29.14 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.54 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.71 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 447 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 713 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  24.64 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  25.52 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.24 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  26.2 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25.83 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.52 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  23.76 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.21 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>