215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1279 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  100 
 
 
392 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  39.68 
 
 
407 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  39.18 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 
389 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 
389 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  38.89 
 
 
388 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  37.64 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  38.79 
 
 
395 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  36.2 
 
 
394 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
388 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  37.08 
 
 
380 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  37.53 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  35.69 
 
 
394 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 
394 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
397 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  31.79 
 
 
392 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  31.62 
 
 
376 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  30.33 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  35.22 
 
 
375 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
402 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  30.59 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  32.88 
 
 
377 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  30.14 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  31.89 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  30.14 
 
 
387 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  29.66 
 
 
385 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  28.57 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  29.13 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.1 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.79 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  28.87 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  28.68 
 
 
404 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  29.86 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  29.86 
 
 
386 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  30.14 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  29.2 
 
 
389 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
386 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  28.18 
 
 
379 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  29.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  29.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  29.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  29.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  29.2 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.69 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  28.69 
 
 
386 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
379 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  27.75 
 
 
379 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  29.47 
 
 
382 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  28.61 
 
 
382 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.43 
 
 
421 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  26.54 
 
 
379 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  29.89 
 
 
386 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.12 
 
 
446 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
383 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
430 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  27.51 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  28.76 
 
 
311 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  25.28 
 
 
416 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  26.76 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  24.83 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 
426 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  24.83 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.91 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
418 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.11 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.29 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
418 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.43 
 
 
409 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.45 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  26.12 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  24.87 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.58 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.64 
 
 
438 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.72 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  26.69 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  29.55 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.98 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.35 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.09 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  25.81 
 
 
444 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  26.16 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  26.16 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  26.16 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25.17 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  26.37 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  27.61 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.93 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25.89 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>