218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0193 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  93.93 
 
 		 379 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  93.4 
 
 		 379 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  93.93 
 
 		 379 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  79.27 
 
 		 381 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  74.14 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  73.09 
 
 		 382 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  71.62 
 
 		 382 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  74.33 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  73.8 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  67.65 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 386 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  30.85 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  30.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  30.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  31.12 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  31.94 
 
 		 311 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 380 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  26.56 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  29.18 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  22.81 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  27.42 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  26.55 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 713 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>