227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1275 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  84.29 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  80.62 
 
 		 389 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  35.64 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 380 aa  176  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  32.14 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  31.59 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 389 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  32.58 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 375 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  30 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  31.41 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.58 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 436 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  27.9 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 430 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.87 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  24.87 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  28.98 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  23.31 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  24.53 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  25.82 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  24.26 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  25.15 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  27.02 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.63 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>