251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2825 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  100 
 
 
413 aa  810    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
389 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  43.4 
 
 
407 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  41.26 
 
 
394 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  42.82 
 
 
388 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 
388 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 
389 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  39.95 
 
 
394 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
394 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  46.13 
 
 
388 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  43.3 
 
 
380 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  43.59 
 
 
380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  43.77 
 
 
380 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 
397 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 
394 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  44.35 
 
 
395 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  41.03 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  41.02 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
402 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  39.48 
 
 
392 aa  192  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  34.31 
 
 
388 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.97 
 
 
382 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  36.09 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.67 
 
 
392 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
389 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  34.79 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  34.79 
 
 
379 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  34.79 
 
 
379 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  34.53 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  34.81 
 
 
382 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  32.33 
 
 
376 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  34.71 
 
 
379 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.53 
 
 
387 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  33.59 
 
 
387 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  31.77 
 
 
386 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  35.08 
 
 
377 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  32.21 
 
 
386 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  32.21 
 
 
386 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  32.21 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  32.21 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  32.21 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  31.41 
 
 
386 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
386 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  29.86 
 
 
385 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  30.92 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  31.37 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  32.54 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  32.64 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  28.05 
 
 
404 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  32.28 
 
 
385 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  29.37 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  29.37 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  29.37 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  29.37 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  29.37 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  29.1 
 
 
389 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.8 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  24.54 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
418 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  29.45 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.92 
 
 
726 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
430 aa  106  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  25.13 
 
 
411 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  29.21 
 
 
311 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  24.36 
 
 
398 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  24.31 
 
 
416 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  24.36 
 
 
398 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  24.36 
 
 
398 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  24.36 
 
 
398 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  24.36 
 
 
398 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.58 
 
 
429 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  23.72 
 
 
418 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  26.24 
 
 
444 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.47 
 
 
398 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  23.72 
 
 
418 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.08 
 
 
398 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  27.67 
 
 
381 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  23.65 
 
 
398 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.83 
 
 
471 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  26.74 
 
 
411 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  26.49 
 
 
431 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.96 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.08 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  25.59 
 
 
713 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  30.1 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  26.3 
 
 
446 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  30.1 
 
 
382 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  23.18 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  23.8 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  29.43 
 
 
436 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>