262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0703 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  98.19 
 
 		 386 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  99.48 
 
 		 386 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  95.08 
 
 		 386 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  96.63 
 
 		 386 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  98.19 
 
 		 386 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  98.19 
 
 		 386 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  81.09 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  82.11 
 
 		 389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  82.11 
 
 		 389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  82.11 
 
 		 389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  82.11 
 
 		 389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  82.11 
 
 		 389 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  81.84 
 
 		 389 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  74.22 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  74.22 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  70.39 
 
 		 385 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  81.13 
 
 		 311 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.66 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.13 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 392 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  32.35 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.79 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  34.13 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  35.95 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  28.61 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  30 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.64 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  24.47 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.86 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  24.21 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.93 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.5 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.85 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  22.61 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.41 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.37 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  28.57 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.54 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  25.72 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>