256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0928 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  73.28 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  71.95 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  72.52 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  53.83 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  53.83 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  43.02 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  30 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  30 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  32.75 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  29.97 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  29.68 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  29.3 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  27.79 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  27.6 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  27.79 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  27.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  27.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  25.09 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  27.73 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  27.66 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 424 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.72 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  25 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 446 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  26.98 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  25 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  26.96 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>