229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7414 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  718    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  88.14 
 
 
388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  65.44 
 
 
389 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  64.8 
 
 
407 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  67.31 
 
 
395 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  66.57 
 
 
389 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  56.77 
 
 
388 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  46.07 
 
 
394 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
394 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  47.57 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
394 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  45.16 
 
 
413 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  46.36 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  46.89 
 
 
380 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  46.61 
 
 
380 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  44.69 
 
 
397 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  46.2 
 
 
375 aa  249  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  40.1 
 
 
392 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  35.67 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.59 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
402 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.67 
 
 
382 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  32.21 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.69 
 
 
387 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  30.16 
 
 
386 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.79 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.4 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  31.87 
 
 
386 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  32.16 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.6 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  31.29 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  31.29 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  31.29 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  31.29 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  32.66 
 
 
404 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.67 
 
 
377 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.04 
 
 
382 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  32.2 
 
 
386 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  32.44 
 
 
382 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  32.65 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  32.65 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  32.16 
 
 
386 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  32.65 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  32.65 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  32.65 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  30.79 
 
 
379 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
377 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  30.9 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  32.36 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  31.61 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  31.61 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.75 
 
 
385 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  29.6 
 
 
379 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  31.49 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  30.47 
 
 
385 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
398 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
381 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28.18 
 
 
409 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.92 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  27.47 
 
 
398 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  27.75 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  27.75 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  27.47 
 
 
398 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
398 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
398 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  27.47 
 
 
398 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  26.05 
 
 
398 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.58 
 
 
447 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  29.72 
 
 
416 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
436 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.38 
 
 
418 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.38 
 
 
418 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  25.8 
 
 
429 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.99 
 
 
417 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.15 
 
 
428 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.51 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  26.15 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  31.34 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.64 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.17 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.17 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.58 
 
 
412 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  28.08 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  32.94 
 
 
420 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.97 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.78 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  26.54 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>