196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4139 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  756    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  77.36 
 
 
383 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
388 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 
388 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  38.67 
 
 
386 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  39.16 
 
 
385 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  38.9 
 
 
385 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  37.25 
 
 
385 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  36.44 
 
 
386 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  39.39 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  36.47 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  36.47 
 
 
386 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  36.47 
 
 
386 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  36.47 
 
 
386 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  36.47 
 
 
386 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.68 
 
 
382 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  35.43 
 
 
404 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36.34 
 
 
386 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  33.52 
 
 
387 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  33.52 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  34.9 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  36.29 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  36.39 
 
 
386 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  33.16 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  33.52 
 
 
379 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  34.86 
 
 
389 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  33.52 
 
 
379 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  33.52 
 
 
379 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  34.71 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  34.18 
 
 
382 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  37.72 
 
 
311 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  26.98 
 
 
413 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.12 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  29.12 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  29.31 
 
 
388 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  29.28 
 
 
392 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  30.41 
 
 
395 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  28.26 
 
 
394 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  26.82 
 
 
380 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
380 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  26.82 
 
 
376 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.22 
 
 
380 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
430 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  28.87 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
389 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
394 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  27.61 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  30.19 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  27.47 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  26.71 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.77 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.96 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.99 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  24.38 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.15 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  29.35 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  24.09 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  24.09 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  22.99 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  29.56 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.65 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  26.35 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  26.07 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  23.47 
 
 
471 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  25 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.27 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  25.88 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  26.65 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  24.11 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.82 
 
 
421 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  24.34 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  27.6 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.28 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.3 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  24.33 
 
 
418 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  24.47 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  24.09 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  25.61 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  26.32 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  25.74 
 
 
382 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  23.95 
 
 
418 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  25.4 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  25.18 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  23.76 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>