295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0238 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  100 
 
 		 382 aa  732    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  83.02 
 
 		 387 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  82.49 
 
 		 387 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  72.43 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  72.16 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 379 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  71.62 
 
 		 379 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  71.62 
 
 		 379 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  71.62 
 
 		 377 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  68.5 
 
 		 382 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  67.55 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  40.88 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  33.51 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  33.6 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  33.6 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  33.6 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  35.91 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  31.81 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 389 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  31.7 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 394 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 412 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  25.96 
 
 		 465 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  28.36 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  26 
 
 		 433 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  26.69 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  26.69 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25.08 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  26.06 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  25.81 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  22.6 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  25.82 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.53 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  24.77 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>