257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3989 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  816    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  60.93 
 
 
388 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3194  major facilitator transporter  35.94 
 
 
388 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
377 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  25.89 
 
 
398 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  26.14 
 
 
398 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  25.63 
 
 
398 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.89 
 
 
398 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.89 
 
 
398 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.89 
 
 
398 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
398 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.63 
 
 
398 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  24.23 
 
 
396 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
398 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  26.55 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  26.74 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  26.74 
 
 
382 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  23.71 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  24.72 
 
 
381 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  23.97 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.53 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  25.27 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
394 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  25.28 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  25 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  25 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  25 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  25 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  24.7 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  22.78 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  26.95 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  22.22 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  23.89 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  22.93 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  23.89 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  23.54 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  26.04 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  22.66 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  23.54 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  22.4 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  24.41 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  25.41 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  23.54 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  23.8 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  23.49 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  23.18 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  21.28 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  24.72 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  23.54 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  23.18 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  21.45 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  22.59 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  22.59 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  22.59 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  21.72 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  23.43 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  22.26 
 
 
379 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.42 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  26.65 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  21.97 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  24.83 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  23.46 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  20.31 
 
 
474 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.65 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  23.55 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  23.5 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  28.99 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  29.71 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  29.71 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  24.89 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  23.55 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 
397 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  21.24 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  20.25 
 
 
438 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  21.24 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  21.24 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  21.24 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  21.24 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  20.25 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  20.86 
 
 
459 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.95 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>