More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4752 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  60.93 
 
 
410 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3194  major facilitator transporter  33.82 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  22.57 
 
 
405 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
377 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  22.47 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  24.86 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  21.64 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
381 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  23.12 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  21.76 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  22.84 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  22.28 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  22.56 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  24.23 
 
 
398 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  22.28 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  22.56 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  23.53 
 
 
413 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  22.71 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.1 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  23.38 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  20.6 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  25.07 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  19.89 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  24.63 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  19.89 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  22.91 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  20.33 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  20.33 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  25.74 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  20.33 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  20.33 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  20.33 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  24.5 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  24.5 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  21.76 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  24.43 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  24.93 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  23.67 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  24.87 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  22.38 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  25.61 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  25.34 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  23.33 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  21.87 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  24.32 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  21.49 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  22.83 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  23.25 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  21.26 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  22.19 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  21.26 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  20.5 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  23.15 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  23.08 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  23.08 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  24.02 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  22.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  22.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  22.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  22.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  22.96 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  21.52 
 
 
447 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  22.74 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  20.67 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  25.34 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  22.26 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  21.83 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  24.28 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  20.11 
 
 
465 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  22.26 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.19 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  18.71 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  23.22 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>