179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3745 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  764    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  90.72 
 
 		 388 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  36.29 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  36.89 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  36.61 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  36.61 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  36.61 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  36.61 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.94 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.64 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  35.47 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  32 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  32 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.23 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  32.73 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  26.46 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  24.44 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4671  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  22.38 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  24.24 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.11 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  24 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  25.49 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  25.73 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  23.29 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  22.7 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  22.96 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  20.74 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>