218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1776 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 389 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  84.51 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  80.62 
 
 		 388 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  33.06 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  34.54 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  34.54 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  31.75 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  31.48 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  33.07 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  31.1 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 379 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  31.73 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  28.99 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 375 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  25.93 
 
 		 404 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.74 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  29.29 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  25.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  25.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  25.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  25 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  25.07 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.69 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  26.48 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  26.44 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0275  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  21.62 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>