266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4927 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 389 aa  725    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  92.54 
 
 		 407 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  93.57 
 
 		 389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  64.27 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  65.21 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  43.62 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  45.87 
 
 		 397 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  43.82 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  34.12 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.12 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  31.59 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  32.36 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 385 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  35.65 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  32.17 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 386 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  28.96 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  26.98 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  26.98 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  27.55 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  30.17 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  28.75 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 417 aa  99.8  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 429 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 418 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  28.44 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  27.09 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  27.09 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  26.8 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 398 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.11 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>