225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5329 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  98.94 
 
 		 379 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  93.4 
 
 		 379 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  98.94 
 
 		 379 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  80.11 
 
 		 381 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  73.35 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  72.16 
 
 		 382 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  73.53 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  72.87 
 
 		 387 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  72.61 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  65.43 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  37.57 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  32.87 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  31.08 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  31.08 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  31.08 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  31.08 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  30.84 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  32.09 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  24.93 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.76 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  26.9 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  29.3 
 
 		 429 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>