220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  100 
 
 
377 aa  698    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  71.62 
 
 
382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  72.15 
 
 
387 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  72.41 
 
 
387 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  67.11 
 
 
381 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  67.65 
 
 
379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  65.43 
 
 
379 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  65.51 
 
 
379 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  65.51 
 
 
379 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  62.86 
 
 
382 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  63.3 
 
 
382 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  40.38 
 
 
386 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  40.5 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  40.5 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  35.98 
 
 
386 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36.42 
 
 
386 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  40.22 
 
 
385 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  35.69 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  35.69 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  35.69 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  35.41 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  35.13 
 
 
385 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  35.41 
 
 
386 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
386 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
383 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  33.79 
 
 
404 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  35.69 
 
 
386 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  35.08 
 
 
413 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
388 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  33.24 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  33.24 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  33.24 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  33.24 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  33.24 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
392 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  32.97 
 
 
389 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
397 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  33.42 
 
 
392 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  38.71 
 
 
395 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  33.33 
 
 
376 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
389 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  35.05 
 
 
407 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  33.78 
 
 
311 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  32.88 
 
 
392 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  32.42 
 
 
380 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 
389 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  31.59 
 
 
394 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  32.75 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.58 
 
 
388 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
389 aa  136  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  31.91 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
380 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  31.22 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  34.35 
 
 
375 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.95 
 
 
393 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  34.01 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
394 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  29.46 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.53 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  22.49 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.33 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.63 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  26.32 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  22.66 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  22.66 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  22.66 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  22.66 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.68 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  22.8 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  22.4 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  25.8 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.25 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  22.4 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.74 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  22.54 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.9 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  22.54 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.07 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  24.58 
 
 
417 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.85 
 
 
465 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  26.82 
 
 
471 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  26.14 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.67 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  21.41 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  21.5 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  28.88 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.22 
 
 
474 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.53 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.97 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.88 
 
 
428 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.56 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.97 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>