More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2433 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  100 
 
 
385 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  84.68 
 
 
386 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  84.07 
 
 
386 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  72.75 
 
 
404 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  70.39 
 
 
386 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  70.65 
 
 
386 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  70.13 
 
 
386 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  70.65 
 
 
386 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  70.65 
 
 
386 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  70.39 
 
 
386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  72.49 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  72.22 
 
 
389 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  72.49 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  70.65 
 
 
386 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  72.49 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  72.49 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  72.49 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  72.33 
 
 
311 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
388 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
388 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  36.16 
 
 
382 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  36.27 
 
 
386 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  34.47 
 
 
381 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  35.59 
 
 
387 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  35.31 
 
 
387 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  32.71 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  32.71 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  32.72 
 
 
379 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  35.39 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  33.43 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  34.58 
 
 
382 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  34.79 
 
 
377 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  34.87 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  34.55 
 
 
385 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  34.36 
 
 
385 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  28.78 
 
 
413 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.14 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  31.78 
 
 
392 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  26.93 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  27.82 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  29.38 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  26.88 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  29.33 
 
 
392 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
389 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  29.57 
 
 
407 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  28.12 
 
 
380 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  26.5 
 
 
394 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
389 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  28.8 
 
 
375 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  27.9 
 
 
388 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.35 
 
 
388 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
398 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  24.54 
 
 
398 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  24.54 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  25.4 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  24 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.46 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.46 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.94 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.71 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.42 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.18 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  23.1 
 
 
713 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.89 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  23.4 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28.57 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  27.71 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.93 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  22.73 
 
 
398 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.24 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.26 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  27.3 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.24 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  23.77 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  24.93 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  25.2 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  23.32 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  24.32 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  24.93 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  23.48 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.63 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  24.52 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  26.6 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>