220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0094 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  725    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  96.34 
 
 		 382 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  77.13 
 
 		 381 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  73.53 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  73.53 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  73.53 
 
 		 379 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  73.09 
 
 		 379 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  67.55 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  67.63 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  68.16 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  62.86 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  35 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  34.09 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  33.14 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  32.2 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  35.88 
 
 		 311 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  30 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  24.36 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 713 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  22.02 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  21.75 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  21.6 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  21.87 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  24.22 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  28.2 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  21.49 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  24.22 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.92 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  24.08 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  18.93 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  25.14 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.37 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>