226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0339 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  98.7 
 
 
386 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  97.41 
 
 
386 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  94.56 
 
 
386 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  98.19 
 
 
386 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  81.09 
 
 
404 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  82.11 
 
 
389 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  81.84 
 
 
389 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  82.11 
 
 
389 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  82.11 
 
 
389 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  82.11 
 
 
389 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  82.11 
 
 
389 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  74.22 
 
 
386 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  74.22 
 
 
386 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  70.65 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  81.79 
 
 
311 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
388 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
388 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  34.47 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
383 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  34.34 
 
 
387 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  33.79 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  39.38 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  32.27 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  32.27 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  31.91 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  32.28 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  35.07 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  36.46 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  37.37 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  33.96 
 
 
382 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  35.95 
 
 
385 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.62 
 
 
382 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  31.85 
 
 
413 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  30 
 
 
376 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  33.06 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  30.39 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
397 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  28.33 
 
 
394 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  31.16 
 
 
407 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  26.76 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  29.48 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  26.72 
 
 
394 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  29.14 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  26.76 
 
 
380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
389 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.07 
 
 
380 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
388 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  30.71 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  30.03 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
389 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
394 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  30.45 
 
 
388 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  30.72 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  26.15 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  25.93 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
398 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  25.57 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  28.24 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.85 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  23.78 
 
 
713 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  28.18 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  22.93 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.34 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  25.82 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25.6 
 
 
481 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.74 
 
 
464 aa  76.6  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  28.66 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  25.67 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  24.57 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  25.82 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  22.69 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.15 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.54 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.11 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  28.62 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  22.5 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  25.74 
 
 
476 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  25.72 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  26.42 
 
 
471 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  24.4 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.97 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>