256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3861 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  740    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  56.77 
 
 
388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  52.89 
 
 
389 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  51.7 
 
 
407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  56.18 
 
 
388 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 
389 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  43.64 
 
 
394 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  41.9 
 
 
413 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  51.99 
 
 
395 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  45.07 
 
 
394 aa  282  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
394 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  43.05 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  43.05 
 
 
380 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
380 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
394 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  45.45 
 
 
375 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  36.86 
 
 
392 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  38.3 
 
 
392 aa  192  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  30.9 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.01 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  34.18 
 
 
393 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  31.32 
 
 
386 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
389 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  33.14 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  33.24 
 
 
386 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  33.24 
 
 
386 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  33.24 
 
 
386 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  33.24 
 
 
386 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  33.24 
 
 
386 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  32.94 
 
 
386 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  31.16 
 
 
385 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
385 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  31.49 
 
 
387 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  31.2 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  29.89 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  31.96 
 
 
377 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  28.21 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  32.94 
 
 
386 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  28.21 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  29.31 
 
 
381 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  28.08 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
386 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  29.89 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  30.2 
 
 
404 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  29.14 
 
 
382 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  28.24 
 
 
382 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
377 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  28.2 
 
 
385 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.81 
 
 
418 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  29.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  29.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  29.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  29.91 
 
 
389 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0357  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
380 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  29.43 
 
 
389 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.2 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.2 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
418 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  24.92 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
398 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.71 
 
 
398 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  25.45 
 
 
398 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.71 
 
 
398 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  25.62 
 
 
447 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
392 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.05 
 
 
429 aa  106  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  25.45 
 
 
398 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
418 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  29.04 
 
 
429 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
418 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
388 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
398 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  25 
 
 
398 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  25.26 
 
 
398 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  25.26 
 
 
398 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.11 
 
 
416 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
383 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  30.77 
 
 
412 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  27.78 
 
 
433 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
430 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  23.51 
 
 
424 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
388 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  25.77 
 
 
421 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  26.59 
 
 
409 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  26.89 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.44 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  23.97 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
311 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0275  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
380 aa  96.3  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
436 aa  95.9  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.69 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
417 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.67 
 
 
412 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>