227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3172 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  100 
 
 
389 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  99.74 
 
 
389 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  94.34 
 
 
404 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  100 
 
 
389 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  100 
 
 
389 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  100 
 
 
389 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  100 
 
 
389 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  99.36 
 
 
311 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  82.11 
 
 
386 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  82.11 
 
 
386 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  82.11 
 
 
386 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  82.11 
 
 
386 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  81.84 
 
 
386 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  81.05 
 
 
386 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  82.89 
 
 
386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  75.32 
 
 
386 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  74.67 
 
 
386 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  72.49 
 
 
385 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
388 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
388 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  33.6 
 
 
382 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  37.64 
 
 
386 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  32.78 
 
 
387 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  32.51 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  33.43 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  33.71 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  33.14 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  35.93 
 
 
385 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
392 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  35.65 
 
 
385 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  31.05 
 
 
379 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  31.05 
 
 
379 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  31.05 
 
 
379 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  35.1 
 
 
385 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  33.24 
 
 
377 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  30.3 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  28.95 
 
 
413 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  30.38 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  27.87 
 
 
376 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  27.27 
 
 
394 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
388 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  27.93 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  30.09 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  30.47 
 
 
392 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  33.23 
 
 
388 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  30.14 
 
 
407 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
394 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
402 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
389 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  27.45 
 
 
380 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  29.46 
 
 
392 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.45 
 
 
380 aa  106  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.45 
 
 
380 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
389 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  28.49 
 
 
375 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  26.93 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  26.22 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  26.45 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
389 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  24.85 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  25.62 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  25.65 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  25.62 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  27.49 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  24.4 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  26.9 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  24.31 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  27.14 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  27.99 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.23 
 
 
713 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  24.27 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  27.51 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  25.07 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.26 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.26 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.56 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.11 
 
 
464 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  24.92 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  23.69 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.62 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.25 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  24.58 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  24.75 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.24 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  23.59 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.01 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  25.07 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  28.82 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  26.65 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>