More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3353 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  828    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.48 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.98 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.98 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.97 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.98 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.97 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.18 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.07 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.57 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.32 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.42 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  25.58 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 439 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  26.1 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  26.1 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  26.1 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.99 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  23.86 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.18 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  25.41 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.31 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.31 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.94 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.31 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  23.14 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  21.94 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20840  Major Facilitator Superfamily transporter  23.24 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.6 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.55 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.31 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.09 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.9 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.08 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.15 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  23.62 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  24.15 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.15 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.7 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.15 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.7 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.15 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  22.01 
 
 		 1816 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>