More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0087 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  91.97 
 
 
440 aa  805    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  78.22 
 
 
442 aa  669    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  866    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  56.53 
 
 
433 aa  495  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  56.74 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  52.53 
 
 
429 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  49.06 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  39.16 
 
 
412 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.78 
 
 
474 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.21 
 
 
418 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  37.88 
 
 
428 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  37.91 
 
 
441 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  33.82 
 
 
424 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
419 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
431 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.24 
 
 
413 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.07 
 
 
474 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.53 
 
 
446 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.74 
 
 
412 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.67 
 
 
447 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
440 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.23 
 
 
418 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
408 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
432 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  32.54 
 
 
426 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
403 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
453 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
450 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  36.29 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  37.79 
 
 
414 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
401 aa  219  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 
378 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
421 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
418 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
415 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.81 
 
 
413 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
423 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
404 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
428 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  34.75 
 
 
450 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 
417 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
456 aa  206  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
418 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  34.86 
 
 
426 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  38.28 
 
 
452 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  34.16 
 
 
413 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  34.16 
 
 
413 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
433 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  34.58 
 
 
413 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 
417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  30.24 
 
 
413 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  31.67 
 
 
426 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  34.91 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  36.49 
 
 
405 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
419 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
421 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
402 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
453 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
410 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
409 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.53 
 
 
446 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
405 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
476 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.51 
 
 
410 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
446 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  30.79 
 
 
410 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
413 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
431 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
420 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  31.96 
 
 
457 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  34.46 
 
 
424 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  34.28 
 
 
405 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  31.3 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  34.48 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
436 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
435 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  28.64 
 
 
431 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  33.92 
 
 
416 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  32 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  35.66 
 
 
441 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.5 
 
 
407 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 
419 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
417 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  33.75 
 
 
412 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  31.63 
 
 
418 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  34.22 
 
 
416 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
404 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  28.61 
 
 
403 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  32.72 
 
 
450 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.43 
 
 
435 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  31.04 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.41 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>