More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2769 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  783    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  59.05 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  45.74 
 
 
445 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  38.48 
 
 
418 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  45.31 
 
 
478 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  38.48 
 
 
418 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  38.48 
 
 
418 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  37.4 
 
 
414 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  35.85 
 
 
412 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
430 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  35.64 
 
 
419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  36.88 
 
 
469 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  33.59 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  31.82 
 
 
417 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.88 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
414 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  29.4 
 
 
408 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  28.16 
 
 
408 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  30.14 
 
 
424 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  30.77 
 
 
412 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
418 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  29.33 
 
 
408 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.73 
 
 
390 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.73 
 
 
390 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  30.83 
 
 
412 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  27.82 
 
 
408 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.82 
 
 
408 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.82 
 
 
408 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.03 
 
 
436 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
428 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  30.68 
 
 
413 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.16 
 
 
1833 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.66 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.62 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.14 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.3 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.48 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.48 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.27 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.72 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  29.4 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.07 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.07 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.47 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.87 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.5 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.5 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.5 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.5 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.46 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.68 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.13 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  20.75 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.25 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.61 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.26 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.15 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  29.56 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  28.02 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.32 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  23.89 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  24.09 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.68 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.57 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.01 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.37 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.03 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  30.58 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  23.41 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.82 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.32 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>