246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2420 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 430 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2172  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  hitchhiker  0.0000450319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  45.5 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  32.39 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  34.6 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  34.6 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  34.6 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  32.32 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 478 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  31.51 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  30.75 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  27.79 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.04 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.3 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.08 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.08 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.58 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.58 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.67 
 
 		 408 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.32 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  26.22 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.67 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.74 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.08 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.3 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.63 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.54 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.5 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.5 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.5 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.5 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.99 
 
 		 1833 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.87 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.32 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.97 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25.67 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.62 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.25 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.9 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  30.93 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  21.13 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  21.13 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.21 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  21.97 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  21.97 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.7 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.62 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  20.63 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.62 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  27.67 
 
 		 705 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>