More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1564 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  737    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  59.43 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  35.25 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  36.53 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  36.53 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  36.53 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  33.92 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  37.22 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  33.5 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  36.62 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  32.95 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 428 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  26.37 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  25.68 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  28.63 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  28.95 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  28.23 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  27.82 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  28.23 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  18.98 
 
 		 1833 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  28.88 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.87 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.04 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.24 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.49 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.76 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.76 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.76 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.94 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.34 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.88 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.34 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.54 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.81 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.54 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.28 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.18 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  19.71 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  29.12 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.73 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  28.3 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>