More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1534 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  826    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  43.36 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  44.81 
 
 		 424 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 465 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  35.9 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  35.86 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 425 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  35.71 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  30.33 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25.09 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24 
 
 		 404 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.47 
 
 		 404 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.47 
 
 		 404 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.91 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 433 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  26.78 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  23.66 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.22 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.86 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  27.01 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.58 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.67 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.86 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.86 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.09 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  20.98 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  20.98 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.22 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.91 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  21.45 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  21.26 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  28.57 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.97 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.47 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.98 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.47 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.73 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.36 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.73 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.36 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.21 
 
 		 448 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.36 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  30.18 
 
 		 420 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  30.18 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  21.47 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  21.1 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.74 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  29.59 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.19 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.6 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  25.36 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  29.59 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>