149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3537 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  100 
 
 		 465 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  84.91 
 
 		 465 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  40.96 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  37.97 
 
 		 431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  36.95 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  30.33 
 
 		 402 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  32.96 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  27.06 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  30.15 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.88 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  26.34 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  20.6 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.43 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  27.92 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 727 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.46 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  21.46 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.7 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  20.85 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  20.85 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.53 
 
 		 1833 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.19 
 
 		 709 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  25.26 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  19.83 
 
 		 409 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  26.04 
 
 		 703 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.4 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  21.97 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 710 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  24.64 
 
 		 1816 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  20.57 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  25.49 
 
 		 730 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  25.26 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  19.95 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.89 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.32 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.08 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  20.83 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  23.75 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.19 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  32.14 
 
 		 642 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.37 
 
 		 404 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.67 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 432 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.67 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  23.41 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>