More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2261 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  46.52 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  46.06 
 
 		 424 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  40.36 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 438 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  44.97 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  40 
 
 		 465 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 465 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  35.21 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 440 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  26.62 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.42 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  21.77 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.63 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.63 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.26 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.89 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.2 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.59 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.1 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  24.81 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.05 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.84 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  31.18 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.87 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.6 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.17 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.6 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  27.4 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.93 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.93 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  31.18 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.84 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.84 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  25.21 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.57 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.36 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.31 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  30.65 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  30.32 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 457 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.81 
 
 		 686 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  30.59 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.84 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.57 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.19 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.28 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.19 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.57 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>