More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6327 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  888    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  38.81 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  38.81 
 
 		 414 aa  289  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  38.71 
 
 		 417 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  36.54 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 405 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 416 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 421 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.53 
 
 		 411 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 427 aa  93.6  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 402 aa  90.1  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 524 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 418 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.5 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  27.99 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  27.74 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.53 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.61 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  27.74 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  27.74 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  27.74 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  30.59 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.62 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  30.95 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.28 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.02 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  28.08 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  27.91 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  30.56 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  30.56 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  30.56 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.16 
 
 		 535 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.48 
 
 		 1829 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.61 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  29.15 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.83 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.67 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>