More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 414 aa  795    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  54.88 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 442 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 408 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.8 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  36.43 
 
 		 289 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.24 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.4 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.57 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.57 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.49 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  28.49 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.49 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  31.65 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 439 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  26.9 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  26.9 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  26.59 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.31 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.11 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  25.54 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.11 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.11 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  25.88 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  24.6 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  27.12 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  27.01 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  26.37 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  25.23 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>