182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6955 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  59.72 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  60.39 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.65 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21960  Major Facilitator Superfamily transporter  34.14 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  33.45 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2652  transmembrane efflux protein  46.94 
 
 		 168 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  19.44 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  27.67 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  29.51 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  25.71 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.97 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.44 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.06 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.52 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2486  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.79 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  24.73 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.38 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  22.13 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.38 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  24.52 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  27.4 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  22.06 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.88 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  21.88 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  22.79 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.48 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  25.48 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.67 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.48 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.1 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  28.41 
 
 		 542 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  27.05 
 
 		 528 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.1 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  28.12 
 
 		 533 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  28.12 
 
 		 533 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.12 
 
 		 686 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  28.12 
 
 		 533 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.65 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.1 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>