More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4089 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  838    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  61.63 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  41.65 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 431 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.04 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.52 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.8 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  25.98 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  25.98 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 406 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.52 
 
 		 410 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  26.74 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  26.74 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  26.74 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  30.52 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  29.84 
 
 		 430 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  27.59 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  29.18 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  27.32 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  27.32 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  27.32 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  27.32 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  27.93 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  26.07 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.57 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.57 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  29.3 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.51 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  28.81 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  28.81 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  28.81 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>