More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0199 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  100 
 
 
378 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  97.14 
 
 
415 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  100 
 
 
378 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  100 
 
 
378 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  96.61 
 
 
415 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  96.61 
 
 
415 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  65.18 
 
 
417 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  55 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
420 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
420 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1403  transporter, putative  86.49 
 
 
148 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.726678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.33 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  34.48 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
420 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.31 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.77 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
430 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
408 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  33.69 
 
 
420 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
444 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
441 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
442 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.31 
 
 
408 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.43 
 
 
428 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
432 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  31.58 
 
 
560 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.07 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.38 
 
 
408 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.17 
 
 
425 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.72 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.07 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
432 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
417 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.65 
 
 
421 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  26.67 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.58 
 
 
415 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.07 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.07 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.07 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.53 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
407 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  20.78 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.19 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.68 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  20.52 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.89 
 
 
1114 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.31 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.31 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  19.11 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.48 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.53 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.29 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.23 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.92 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  32.22 
 
 
551 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.76 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.76 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.11 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.45 
 
 
1131 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.89 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  31.52 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.91 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.74 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.56 
 
 
461 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.29 
 
 
1124 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.46 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.92 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.38 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.29 
 
 
1128 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.19 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  28.85 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  30.48 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  32.43 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  28.45 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.09 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  27.98 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>