More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0365 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  100 
 
 
427 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
420 aa  250  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 
433 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  35.32 
 
 
417 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  35 
 
 
418 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.93 
 
 
405 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
430 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.93 
 
 
405 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.83 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  32.45 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
420 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  32.43 
 
 
445 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 
411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  32.22 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  34.53 
 
 
426 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
417 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  34.2 
 
 
402 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.33 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.33 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.27 
 
 
423 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.47 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.93 
 
 
418 aa  113  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
415 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
432 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
412 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  32.31 
 
 
414 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
433 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.84 
 
 
427 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.36 
 
 
412 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.52 
 
 
416 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  30.93 
 
 
436 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.29 
 
 
408 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  31.02 
 
 
415 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  32.23 
 
 
435 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
429 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
444 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.87 
 
 
408 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.68 
 
 
436 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.73 
 
 
408 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.43 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.73 
 
 
408 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.34 
 
 
418 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.84 
 
 
456 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.39 
 
 
418 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  34.81 
 
 
439 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.9 
 
 
408 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.22 
 
 
390 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
451 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
433 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.36 
 
 
408 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.22 
 
 
390 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
442 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.84 
 
 
431 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
426 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.47 
 
 
408 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.73 
 
 
408 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
440 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.43 
 
 
416 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
432 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.61 
 
 
428 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.7 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.24 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.77 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.78 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.78 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.54 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
415 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
450 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.45 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.17 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
417 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.53 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.79 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  29.28 
 
 
414 aa  93.6  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
442 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.86 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.25 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  24.03 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.25 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  24.03 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  22.93 
 
 
434 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.25 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.7 
 
 
420 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  28.67 
 
 
412 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>