More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1193 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  783    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  35.7 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
423 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  38.26 
 
 
414 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
420 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
415 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.41 
 
 
435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
430 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
416 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
433 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
426 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.23 
 
 
436 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  34.24 
 
 
408 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
417 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  35.29 
 
 
439 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  34.83 
 
 
431 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  37.19 
 
 
420 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.14 
 
 
413 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
439 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
444 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.98 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.34 
 
 
405 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.34 
 
 
405 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  28.75 
 
 
421 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
420 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
406 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
405 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.76 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  26.78 
 
 
410 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.24 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.76 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
401 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  32.02 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  32.02 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  32.02 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
429 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.34 
 
 
427 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.81 
 
 
417 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25 
 
 
414 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.61 
 
 
435 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.98 
 
 
414 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.07 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  28.87 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
461 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.15 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.09 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.05 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.34 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.3 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.71 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  30.81 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  26.85 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.41 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.91 
 
 
404 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.12 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.11 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.3 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.47 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.7 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.53 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.06 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.37 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.98 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.91 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.23 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.23 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.38 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.24 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.26 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.44 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  27.35 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.53 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.62 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.18 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.62 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.52 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
499 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.79 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.79 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  30.26 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>