More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3450 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 499 aa  982    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 434 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 438 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.27 
 
 		 1833 aa  292  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 449 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  37.3 
 
 		 1816 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 449 aa  258  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 432 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.05 
 
 		 1829 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.59 
 
 		 2720 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 439 aa  200  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  31.63 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  28.37 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.89 
 
 		 1876 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.79 
 
 		 1864 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.67 
 
 		 1806 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  28.75 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.81 
 
 		 1839 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 		 1769 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.16 
 
 		 1776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 437 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  30 
 
 		 428 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.53 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.74 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  26.11 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.46 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  26.74 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.74 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  26.74 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  27.58 
 
 		 927 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  26.46 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 474 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 428 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  27.02 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  23.48 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 390 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.18 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 390 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  29.86 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  23.32 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23.48 
 
 		 434 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  23.32 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 420 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.39 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.42 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  23.85 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  29.86 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 412 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  26.86 
 
 		 394 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  29.86 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  29.86 
 
 		 417 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  29.86 
 
 		 415 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.22 
 
 		 434 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 461 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 414 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.38 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.26 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25.4 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 416 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  25.41 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 416 aa  90.5  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>