More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0001 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  54.61 
 
 
438 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  42.66 
 
 
1833 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  47.91 
 
 
445 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  46.24 
 
 
1816 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 
432 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 
432 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  47.46 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 
463 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
499 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  45.45 
 
 
449 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 
438 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  40.93 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
448 aa  292  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  40.84 
 
 
495 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.41 
 
 
1829 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  36.06 
 
 
448 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.77 
 
 
1876 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
434 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
434 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  39.51 
 
 
432 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.96 
 
 
1864 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  36.24 
 
 
414 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40.7 
 
 
1776 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.5 
 
 
1839 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  32.78 
 
 
441 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  39.3 
 
 
1769 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36 
 
 
2720 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.67 
 
 
1806 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
433 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  37.33 
 
 
430 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  35.07 
 
 
425 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.27 
 
 
927 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.27 
 
 
927 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  29.43 
 
 
472 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
406 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
432 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  29.02 
 
 
425 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.53 
 
 
405 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  29.04 
 
 
411 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.74 
 
 
390 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.74 
 
 
390 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
440 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1968  major facilitator transporter  31.78 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  43.28 
 
 
134 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
458 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  29.7 
 
 
420 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  27.96 
 
 
422 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  27.96 
 
 
422 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.07 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.69 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  27.42 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  27.69 
 
 
422 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.42 
 
 
422 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  26.34 
 
 
397 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  29.35 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  26.81 
 
 
422 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.77 
 
 
420 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.77 
 
 
420 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.45 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  27.22 
 
 
422 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.72 
 
 
418 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.77 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  28.65 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.46 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  29.23 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.72 
 
 
406 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.8 
 
 
420 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  26.45 
 
 
406 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  25.81 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.17 
 
 
404 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  26.42 
 
 
422 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  26.88 
 
 
422 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  26.17 
 
 
406 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  26.17 
 
 
406 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  29.4 
 
 
420 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
432 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  26.17 
 
 
406 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1259  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
445 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  32.24 
 
 
425 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  26.17 
 
 
404 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
419 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  30.77 
 
 
399 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  30.18 
 
 
414 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.48 
 
 
446 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.95 
 
 
412 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>