More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3727 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  85.43 
 
 		 413 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  87.62 
 
 		 412 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  85.68 
 
 		 413 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  90.39 
 
 		 416 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  85.68 
 
 		 413 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  75.58 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  72.42 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  69.1 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  66.58 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  69.07 
 
 		 404 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  65.09 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  66.41 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  66.94 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  66.49 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  53.61 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  54.39 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  50.4 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  51.71 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  48.38 
 
 		 413 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  51.48 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.55 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 429 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  46.68 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 452 aa  305  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  48.74 
 
 		 405 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 426 aa  272  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 494 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 475 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 450 aa  252  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  40 
 
 		 429 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.76 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.17 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.51 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.64 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 413 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.03 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  32.36 
 
 		 410 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  35.24 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  40.12 
 
 		 428 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 426 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.52 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  36.23 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>